Geht die Karies so tief, dass sich der Wurzelkanal mit Bakterien infiziert, muss der Hohlraum gereinigt, desinfiziert und bakteriendicht verschlossen werden. Damit lässt sich vermeiden, dass die Bakterien bis in den Knochen gelangen und einen Infekt (Abszess,Granulom) verursachen. Falls schon ein Infekt besteht, kann dieser mit Desinfektionseinlagen wieder rückgängig gemacht werden.